Beta-blocker জাতীয় ওষুধ (propranolol, acebutolol, atenolol, labetalol, metoprolol, pindolol, nadolol, sotalol ও timolol) শরীরে Melatonin তৈরির পরিমাণ কমিয়ে দিতে পারে। Ibuprofen ও Melatonin একসাথে খাওয়ার ক্ষেত্রেও ডাক্তার বা ফার্মাসিস্টের পরামর্শ নেওয়া ভালো, বিশেষ করে যদি আপনি এই ধরনের ওষুধ খেয়ে থাকেন। রক্ত পাতলা করার ওষুধ, অ্যান্টিকোয়াগুল্যান্ট: warfarin-এর মতো অ্যান্টিকোয়াগুল্যান্ট ওষুধের সাথে Melatonin খেলে রক্তপাতের ঝুঁকি বাড়তে পারে। Interleukin-2: ক্যান্সারের 80 জন রোগীর উপর করা একটি গবেষণায় দেখা গেছে, শুধু interleukin-2 দিয়ে চিকিৎসার তুলনায় interleukin-2-এর সাথে Melatonin ব্যবহার করলে টিউমার বেশি ছোট হয়েছে এবং রোগীদের বেঁচে থাকার হারও ভালো হয়েছে।
এই ওষুধগুলো একে অপরের ওপর গুরুতর প্রভাব ফেলতে পারে। ডাক্তার অনুমতি না দিলে এগুলো একসাথে খাওয়া শুরু করবেন না। যদি আগে থেকেই দুটোই খেয়ে থাকেন, নিজে থেকে কোনোটি বন্ধ করবেন না: শিগগিরই আপনার ডাক্তার বা ফার্মাসিস্টের সঙ্গে কথা বলুন।