বিটা-ব্লকার (propranolol, acebutolol, atenolol, labetalol, metoprolol, pindolol, nadolol, sotalol এবং timolol) সেবন করলে শরীরে Melatonin তৈরি কমে যেতে পারে। Caffeine সেবনের সঙ্গে এই প্রভাবের কোনো আলাদা উল্লেখ নেই। রক্ত পাতলা করার ওষুধ ও অ্যান্টিকোয়াগুল্যান্ট: warfarin-এর মতো অ্যান্টিকোয়াগুল্যান্ট ওষুধের সঙ্গে Melatonin খেলে রক্তপাতের ঝুঁকি বেড়ে যেতে পারে। Interleukin-2: ক্যান্সারে আক্রান্ত 80 জন রোগীর ওপর করা একটি গবেষণায় দেখা গেছে, interleukin-2 এর সঙ্গে Melatonin ব্যবহার করলে শুধু interleukin-2 দিয়ে চিকিৎসার তুলনায় টিউমার বেশি ছোট হয়েছে এবং রোগীদের বেঁচে থাকার হারও ভালো হয়েছে।
এই ওষুধগুলো একে অপরের ওপর গুরুতর প্রভাব ফেলতে পারে। ডাক্তার অনুমতি না দিলে এগুলো একসাথে খাওয়া শুরু করবেন না। যদি আগে থেকেই দুটোই খেয়ে থাকেন, নিজে থেকে কোনোটি বন্ধ করবেন না: শিগগিরই আপনার ডাক্তার বা ফার্মাসিস্টের সঙ্গে কথা বলুন।